Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC18A3Q16572 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC18A3Q16572 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC18A3Q16572 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC18A3Q16572 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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