Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TAF13Q15543 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF13Q15543 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF13Q15543 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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