Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNN3Q15417 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CNN3Q15417 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNN3Q15417 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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