Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF1Q14990 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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ODF1Q14990 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ODF1Q14990 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ODF1Q14990 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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