Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSPNQ14714 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSPNQ14714 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSPNQ14714 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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