Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERV3-1Q14264 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERV3-1Q14264 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERV3-1Q14264 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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