Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNTB2Q13425 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTB2Q13425 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTB2Q13425 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTB2Q13425 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTB2Q13425 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNTB2Q13425 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNTB2Q13425 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNTB2Q13425 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNTB2Q13425 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SNTB2Q13425 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNTB2Q13425 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SNTB2Q13425 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNTB2Q13425 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNTB2Q13425 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNTB2Q13425 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SNTB2Q13425 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNTB2Q13425 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNTB2Q13425 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNTB2Q13425 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNTB2Q13425 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNTB2Q13425 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNTB2Q13425 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNTB2Q13425 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNTB2Q13425 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNTB2Q13425 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNTB2Q13425 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNTB2Q13425 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNTB2Q13425 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNTB2Q13425 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNTB2Q13425 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNTB2Q13425 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNTB2Q13425 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNTB2Q13425 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNTB2Q13425 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNTB2Q13425 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNTB2Q13425 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNTB2Q13425 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNTB2Q13425 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNTB2Q13425 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNTB2Q13425 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNTB2Q13425 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNTB2Q13425 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNTB2Q13425 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNTB2Q13425 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNTB2Q13425 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNTB2Q13425 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNTB2Q13425 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNTB2Q13425 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNTB2Q13425 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNTB2Q13425 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SNTB2Q13425 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SNTB2Q13425 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNTB2Q13425 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNTB2Q13425 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms