Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENBP1Q13228 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SELENBP1Q13228 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SELENBP1Q13228 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SELENBP1Q13228 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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