Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFX1Q12986 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
NFX1Q12986 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NFX1Q12986 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFX1Q12986 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFX1Q12986 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFX1Q12986 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NFX1Q12986 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NFX1Q12986 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFX1Q12986 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
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