Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt8.4□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 CAF40YNL288W 1122 nt8.4□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 YOR342CYOR342C 960 nt8.4□□□□□ -1.06
TFB4Q12004 LPL1YOR059C 1353 nt8.39□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 YHR218WYHR218W 1812 nt8.39□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 NSE4YDL105W 1209 nt8.39□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 YER137CYER137C 447 nt8.39□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt8.39□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 STS1YIR011C 960 nt8.39□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 SMD3YLR147C 306 nt8.39□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 SPC2YML055W 537 nt8.39□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 PIN2YOR104W 849 nt8.39□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 YBR063CYBR063C 1215 nt8.39□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 MRL1YPR079W 1146 nt8.39□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 YJL171CYJL171C 1191 nt8.38□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 RCL1YOL010W 1104 nt8.38□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 NOB1YOR056C 1380 nt8.37□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 RMD1YDL001W 1293 nt8.37□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 YDL124WYDL124W 939 nt8.37□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 IRC6YFR043C 714 nt8.37□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 FLX1YIL134W 936 nt8.37□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 MIA40YKL195W 1212 nt8.37□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 KRE1YNL322C 942 nt8.37□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 ROX3YBL093C 663 nt8.37□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 YOR152CYOR152C 771 nt8.37□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 HNT3YOR258W 654 nt8.37□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 PEX32YBR168W 1242 nt8.37□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 LSB6YJL100W 1824 nt8.37□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 CTF13YMR094W 1437 nt8.37□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 FIT1YDR534C 1587 nt8.36□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 DMA2YNL116W 1569 nt8.36□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 SPR3YGR059W 1539 nt8.36□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 YIP5YGL161C 933 nt8.36□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 CIR1YGR207C 786 nt8.36□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 OPI3YJR073C 621 nt8.36□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 MBR1YKL093W 1020 nt8.36□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 SPE4YLR146C 903 nt8.36□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 STE50YCL032W 1041 nt8.36□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 PMA2YPL036W 2844 nt8.36□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 QRI7YDL104C 1224 nt8.35□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 AIR2YDL175C 1035 nt8.35□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 TGL2YDR058C 981 nt8.35□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 UPF3YGR072W 1164 nt8.35□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 RSR1YGR152C 819 nt8.35□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 ENT4YLL038C 744 nt8.35□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 BUD9YGR041W 1644 nt8.35□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 CCR4YAL021C 2514 nt8.35□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 KTR7YIL085C 1554 nt8.35□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 SSL2YIL143C 2532 nt8.34□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.34□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 BTN2YGR142W 1233 nt8.34□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt8.34□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 AIM36YMR157C 768 nt8.34□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt8.34□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 YBR053CYBR053C 1077 nt8.34□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 COR1YBL045C 1374 nt8.34□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 ALG1YBR110W 1350 nt8.34□□□□□ -1.07
TFB4Q12004 HMLALPHA2YCL067C 633 nt8.33□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 MATALPHA2YCR039C 633 nt8.33□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 YDR278CYDR278C 318 nt8.33□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 CAB1YDR531W 1104 nt8.33□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 DAM1YGR113W 1032 nt8.33□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 SFK1YKL051W 1062 nt8.33□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 NYV1YLR093C 762 nt8.33□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 PDR16YNL231C 1056 nt8.33□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 FDH1YOR388C 1131 nt8.33□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 YCL041CYCL041C 495 nt8.33□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 YDR249CYDR249C 1122 nt8.32□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 RNA15YGL044C 891 nt8.32□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 CUP1-1YHR053C 186 nt8.32□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 CUP1-2YHR055C 186 nt8.32□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 CTR2YHR175W 570 nt8.32□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 NBP1YLR457C 960 nt8.32□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 AIM34YMR003W 597 nt8.32□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 GID8YMR135C 1368 nt8.32□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 PET112YBL080C 1626 nt8.32□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 ADE16YLR028C 1776 nt8.31□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 AMF1YOR378W 1548 nt8.31□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 PDS1YDR113C 1122 nt8.31□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 MPO1YGL010W 525 nt8.31□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 HAP2YGL237C 798 nt8.31□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 PCT1YGR202C 1275 nt8.31□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 PHB2YGR231C 933 nt8.31□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 EBP2YKL172W 1284 nt8.31□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 HRT3YLR097C 1035 nt8.31□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 YMR007WYMR007W 381 nt8.31□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 MGE1YOR232W 687 nt8.31□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 UBA3YPR066W 900 nt8.31□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 RRT2YBR246W 1164 nt8.31□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 SGV1YPR161C 1974 nt8.31□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 YRF1-2YER190W 5046 nt8.31□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 LYS20YDL182W 1287 nt8.3□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 ACT1YFL039C 1128 nt8.3□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 CYC3YAL039C 810 nt8.3□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 CMC1YKL137W 336 nt8.3□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 YLR046CYLR046C 813 nt8.3□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 YLR123CYLR123C 330 nt8.3□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 EAF7YNL136W 1278 nt8.3□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 YNL190WYNL190W 615 nt8.3□□□□□ -1.08
TFB4Q12004 GSP2YOR185C 663 nt8.3□□□□□ -1.08
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