Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASGEF1BQ0VAM2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASGEF1BQ0VAM2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms