Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LOXL1Q08397 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LOXL1Q08397 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LOXL1Q08397 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms