Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
GOLGA3Q08378 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
GOLGA3Q08378 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC39.44■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
GOLGA3Q08378 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
GOLGA3Q08378 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
GOLGA3Q08378 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
GOLGA3Q08378 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms