Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXM1Q08050 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXM1Q08050 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXM1Q08050 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms