Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBQ06643 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBQ06643 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBQ06643 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBQ06643 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBQ06643 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBQ06643 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBQ06643 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBQ06643 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBQ06643 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBQ06643 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBQ06643 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBQ06643 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBQ06643 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBQ06643 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBQ06643 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBQ06643 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBQ06643 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBQ06643 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBQ06643 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBQ06643 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBQ06643 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBQ06643 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBQ06643 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBQ06643 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBQ06643 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBQ06643 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBQ06643 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBQ06643 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBQ06643 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBQ06643 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBQ06643 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBQ06643 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBQ06643 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBQ06643 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBQ06643 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBQ06643 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBQ06643 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBQ06643 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBQ06643 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBQ06643 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBQ06643 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBQ06643 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBQ06643 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBQ06643 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LTBQ06643 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBQ06643 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBQ06643 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBQ06643 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBQ06643 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBQ06643 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBQ06643 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LTBQ06643 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBQ06643 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBQ06643 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBQ06643 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBQ06643 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBQ06643 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBQ06643 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LTBQ06643 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBQ06643 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LTBQ06643 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBQ06643 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBQ06643 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBQ06643 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBQ06643 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBQ06643 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBQ06643 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBQ06643 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBQ06643 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTBQ06643 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBQ06643 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBQ06643 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTBQ06643 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBQ06643 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBQ06643 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBQ06643 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBQ06643 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTBQ06643 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBQ06643 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBQ06643 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBQ06643 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBQ06643 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBQ06643 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBQ06643 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBQ06643 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBQ06643 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTBQ06643 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBQ06643 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBQ06643 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBQ06643 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBQ06643 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBQ06643 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBQ06643 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBQ06643 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBQ06643 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBQ06643 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LTBQ06643 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBQ06643 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LTBQ06643 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms