Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNG1Q06432 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNG1Q06432 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNG1Q06432 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms