Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EMX2Q04743 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EMX2Q04743 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EMX2Q04743 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms