Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
TOP2BQ02880 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
TOP2BQ02880 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC40.85■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
TOP2BQ02880 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC40.79■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC40.76■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
TOP2BQ02880 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC40.75■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC40.74■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.71■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.71■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC40.7■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
TOP2BQ02880 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
TOP2BQ02880 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms