Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL18AQ02543 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPL18AQ02543 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms