Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OC90Q02509 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OC90Q02509 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OC90Q02509 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OC90Q02509 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OC90Q02509 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OC90Q02509 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OC90Q02509 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OC90Q02509 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OC90Q02509 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OC90Q02509 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
OC90Q02509 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
OC90Q02509 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OC90Q02509 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OC90Q02509 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OC90Q02509 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OC90Q02509 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OC90Q02509 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OC90Q02509 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OC90Q02509 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OC90Q02509 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OC90Q02509 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OC90Q02509 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OC90Q02509 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OC90Q02509 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OC90Q02509 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OC90Q02509 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OC90Q02509 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OC90Q02509 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OC90Q02509 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OC90Q02509 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OC90Q02509 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OC90Q02509 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OC90Q02509 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OC90Q02509 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OC90Q02509 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OC90Q02509 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OC90Q02509 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OC90Q02509 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OC90Q02509 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OC90Q02509 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OC90Q02509 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OC90Q02509 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OC90Q02509 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OC90Q02509 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OC90Q02509 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OC90Q02509 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OC90Q02509 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OC90Q02509 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OC90Q02509 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OC90Q02509 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OC90Q02509 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OC90Q02509 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OC90Q02509 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OC90Q02509 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OC90Q02509 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
OC90Q02509 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OC90Q02509 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
OC90Q02509 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OC90Q02509 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OC90Q02509 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OC90Q02509 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
OC90Q02509 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OC90Q02509 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OC90Q02509 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OC90Q02509 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OC90Q02509 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OC90Q02509 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OC90Q02509 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OC90Q02509 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OC90Q02509 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OC90Q02509 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OC90Q02509 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OC90Q02509 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OC90Q02509 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OC90Q02509 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OC90Q02509 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OC90Q02509 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OC90Q02509 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OC90Q02509 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OC90Q02509 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OC90Q02509 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
OC90Q02509 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OC90Q02509 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
OC90Q02509 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OC90Q02509 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OC90Q02509 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OC90Q02509 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OC90Q02509 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OC90Q02509 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OC90Q02509 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OC90Q02509 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OC90Q02509 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OC90Q02509 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OC90Q02509 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OC90Q02509 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OC90Q02509 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OC90Q02509 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OC90Q02509 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OC90Q02509 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms