Protein–RNA interactions for Protein: Q01973

ROR1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROR1Q01973 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ROR1Q01973 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ROR1Q01973 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ROR1Q01973 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ROR1Q01973 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms