Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP2B2Q01814 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ATP2B2Q01814 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP2B2Q01814 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2B2Q01814 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms