Protein–RNA interactions for Protein: Q01081

U2AF1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1Q01081 ATP5C1-207ENST00000472202 782 ntTSL 26.96□□□□□ -1.31e-6■■■■□ 24.5
U2AF1Q01081 ANKRD28-206ENST00000461696 1878 ntTSL 36.85□□□□□ -1.311e-6■■■■□ 24.5
U2AF1Q01081 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.321e-6■■■■□ 24.5
U2AF1Q01081 MED13L-209ENST00000552340 665 ntTSL 36.68□□□□□ -1.341e-6■■■■□ 24.5
U2AF1Q01081 ANKRD28-212ENST00000497037 3509 ntTSL 26.4□□□□□ -1.381e-6■■■■□ 24.5
U2AF1Q01081 EIF5-217ENST00000561023 565 ntTSL 26.09□□□□□ -1.431e-6■■■■□ 24.5
U2AF1Q01081 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.441e-6■■■■□ 24.5
U2AF1Q01081 SLTM-217ENST00000558756 896 ntTSL 55.72□□□□□ -1.491e-6■■■■□ 24.5
U2AF1Q01081 ANKRD28-202ENST00000412318 4408 ntTSL 25.62□□□□□ -1.511e-6■■■■□ 24.5
U2AF1Q01081 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.611e-6■■■■□ 24.5
U2AF1Q01081 SLTM-210ENST00000497088 716 ntTSL 24.35□□□□□ -1.711e-6■■■■□ 24.5
U2AF1Q01081 HSP90AA1-204ENST00000554401 1710 ntTSL 1 (best)11.46□□□□□ -0.572e-15■■■■□ 24.5
U2AF1Q01081 COPA-202ENST00000368069 4664 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.019e-13■■■■□ 24.4
U2AF1Q01081 COPA-201ENST00000241704 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.179e-13■■■■□ 24.4
U2AF1Q01081 COPA-203ENST00000481040 578 ntTSL 36.86□□□□□ -1.319e-13■■■■□ 24.4
U2AF1Q01081 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.246e-7■■■■□ 24.4
U2AF1Q01081 GRB10-217ENST00000473696 1065 ntTSL 419.57■□□□□ 0.726e-7■■■■□ 24.4
U2AF1Q01081 GRB10-203ENST00000398810 4785 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.436e-7■■■■□ 24.4
U2AF1Q01081 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 24.4
U2AF1Q01081 ELP1-204ENST00000537196 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.073e-6■■■■□ 24.4
U2AF1Q01081 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.279e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 SKP1-206ENST00000519321 692 ntTSL 330.19■■■□□ 2.429e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 SKP1-213ENST00000524288 732 ntTSL 1 (best)7.51□□□□□ -1.219e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.359e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.469e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.59e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 SKP1-207ENST00000520417 610 ntTSL 35.27□□□□□ -1.579e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 SKP1-212ENST00000523966 899 ntTSL 35.15□□□□□ -1.599e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 SKP1-201ENST00000328392 572 ntTSL 55.02□□□□□ -1.619e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.619e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 SKP1-205ENST00000519054 654 ntTSL 34.7□□□□□ -1.669e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.769e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 TIAL1-208ENST00000470635 336 ntTSL 311.41□□□□□ -0.581e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 TIAL1-202ENST00000369087 1566 ntTSL 27.3□□□□□ -1.241e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 TIAL1-204ENST00000412524 515 ntTSL 55.77□□□□□ -1.497e-8■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.422e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.332e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.212e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 MAPK8IP3-207ENST00000564098 4436 ntTSL 220.25■□□□□ 0.832e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 MAPK8IP3-203ENST00000561765 2374 ntTSL 1 (best)19.92■□□□□ 0.782e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 MAPK8IP3-213ENST00000568271 752 ntTSL 519.48■□□□□ 0.712e-7■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 FNBP4-213ENST00000534003 2515 ntTSL 522.38■■□□□ 1.172e-8■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.61e-11■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 METTL22-201ENST00000163678 1510 ntTSL 1 (best)23.58■■□□□ 1.364e-8■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 METTL22-216ENST00000568967 1672 ntTSL 222.3■■□□□ 1.164e-8■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 METTL22-215ENST00000567295 714 ntTSL 320.12■□□□□ 0.814e-8■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.24e-8■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 METTL22-202ENST00000381920 4984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.154e-8■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 HNRNPM-209ENST00000597813 630 ntTSL 226.93■■□□□ 1.93e-6■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 HNRNPM-206ENST00000596984 664 ntTSL 524.89■■□□□ 1.583e-6■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 HNRNPM-203ENST00000593293 764 ntTSL 34.59□□□□□ -1.673e-6■■■■□ 24.3
U2AF1Q01081 ELP2-214ENST00000540766 1049 ntTSL 318.07■□□□□ 0.481e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 GABRE-205ENST00000465405 706 ntTSL 1 (best)11.79□□□□□ -0.522e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 PCM1-209ENST00000518930 575 ntTSL 332.39■■■□□ 2.784e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.744e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.64e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.514e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 TCEA1-210ENST00000522397 852 ntTSL 326.06■■□□□ 1.764e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.764e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ADAM10-212ENST00000558004 587 ntTSL 523.4■■□□□ 1.344e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.324e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.224e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.24e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.094e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 PCM1-218ENST00000523055 1426 ntTSL 1 (best)20.17■□□□□ 0.824e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ADAM10-213ENST00000558733 995 ntTSL 319.7■□□□□ 0.744e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.674e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ADAM10-204ENST00000439637 601 ntTSL 318.52■□□□□ 0.564e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.554e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 TCEA1-207ENST00000521086 2966 ntTSL 1 (best)18.19■□□□□ 0.54e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.414e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.384e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 STK26-203ENST00000394335 3017 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.24e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 OR7E38P-201ENST00000442908 985 ntBASIC14.83□□□□□ -0.044e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 STK26-201ENST00000354719 3179 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.124e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ABCA11P-203ENST00000507854 1503 ntTSL 1 (best)13.99□□□□□ -0.174e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ADD3-201ENST00000277900 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.264e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ADAM10-203ENST00000402627 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.34e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ADAM10-201ENST00000260408 11431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.424e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ADD3-203ENST00000360162 3114 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.474e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ADAM10-214ENST00000559053 541 ntTSL 411.71□□□□□ -0.534e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 COA1-219ENST00000490251 2135 ntTSL 211.6□□□□□ -0.554e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 COA1-204ENST00000415076 1737 ntTSL 311.41□□□□□ -0.584e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ABCA11P-201ENST00000451020 1815 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.584e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 COA1-209ENST00000438444 3223 ntTSL 211.4□□□□□ -0.584e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ZNF721-206ENST00000515578 1679 ntTSL 1 (best)11.11□□□□□ -0.634e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 COA1-210ENST00000446330 1520 ntTSL 210.48□□□□□ -0.734e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 COA1-211ENST00000446564 1177 ntTSL 210.26□□□□□ -0.774e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.824e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ZNF721-202ENST00000505900 664 ntTSL 1 (best)9.59□□□□□ -0.874e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ADAM10-211ENST00000497846 647 ntTSL 48.89□□□□□ -0.994e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ABCA11P-204ENST00000514396 1423 ntTSL 1 (best)8.43□□□□□ -1.064e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.184e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ADD3-212ENST00000486014 317 ntTSL 36.42□□□□□ -1.384e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ADD3-216ENST00000488837 590 ntTSL 36.42□□□□□ -1.384e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.444e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 FUBP3-202ENST00000465949 676 ntTSL 55.49□□□□□ -1.534e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 CDC42BPA-212ENST00000478573 599 ntTSL 55.26□□□□□ -1.574e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ADAM10-202ENST00000396136 2418 ntTSL 1 (best)5.05□□□□□ -1.64e-7■■■■□ 24.2
U2AF1Q01081 ZNF721-204ENST00000507078 355 ntTSL 52.72□□□□□ -1.974e-7■■■■□ 24.2
Retrieved 100 of 10,096 protein–RNA pairs in 41.6 ms