Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK16Q00536 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK16Q00536 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK16Q00536 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms