Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDK6Q00534 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK6Q00534 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK6Q00534 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms