Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RPL30P62888 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RPL30P62888 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL30P62888 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL30P62888 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL30P62888 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL30P62888 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL30P62888 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RPL30P62888 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL30P62888 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL30P62888 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL30P62888 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL30P62888 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL30P62888 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RPL30P62888 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL30P62888 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL30P62888 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL30P62888 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL30P62888 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL30P62888 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL30P62888 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL30P62888 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL30P62888 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL30P62888 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL30P62888 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL30P62888 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPL30P62888 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL30P62888 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL30P62888 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL30P62888 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL30P62888 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPL30P62888 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL30P62888 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL30P62888 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL30P62888 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL30P62888 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL30P62888 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL30P62888 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL30P62888 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RPL30P62888 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL30P62888 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL30P62888 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL30P62888 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL30P62888 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL30P62888 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPL30P62888 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL30P62888 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL30P62888 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL30P62888 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPL30P62888 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL30P62888 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL30P62888 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL30P62888 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL30P62888 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPL30P62888 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL30P62888 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL30P62888 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL30P62888 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL30P62888 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL30P62888 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL30P62888 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL30P62888 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL30P62888 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL30P62888 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPL30P62888 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL30P62888 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL30P62888 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL30P62888 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL30P62888 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL30P62888 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL30P62888 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL30P62888 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL30P62888 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPL30P62888 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL30P62888 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL30P62888 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL30P62888 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL30P62888 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL30P62888 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL30P62888 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL30P62888 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL30P62888 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPL30P62888 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL30P62888 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL30P62888 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL30P62888 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPL30P62888 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL30P62888 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL30P62888 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL30P62888 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL30P62888 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL30P62888 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL30P62888 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL30P62888 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL30P62888 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL30P62888 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL30P62888 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL30P62888 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPL30P62888 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPL30P62888 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms