Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTSWP56202 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTSWP56202 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTSWP56202 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTSWP56202 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTSWP56202 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTSWP56202 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTSWP56202 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTSWP56202 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTSWP56202 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTSWP56202 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTSWP56202 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTSWP56202 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTSWP56202 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTSWP56202 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTSWP56202 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTSWP56202 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTSWP56202 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CTSWP56202 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTSWP56202 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTSWP56202 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTSWP56202 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTSWP56202 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTSWP56202 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTSWP56202 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTSWP56202 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CTSWP56202 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CTSWP56202 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CTSWP56202 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CTSWP56202 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CTSWP56202 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CTSWP56202 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CTSWP56202 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CTSWP56202 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTSWP56202 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTSWP56202 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTSWP56202 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTSWP56202 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTSWP56202 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTSWP56202 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTSWP56202 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CTSWP56202 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CTSWP56202 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CTSWP56202 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CTSWP56202 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CTSWP56202 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CTSWP56202 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTSWP56202 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTSWP56202 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTSWP56202 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTSWP56202 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CTSWP56202 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTSWP56202 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTSWP56202 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTSWP56202 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTSWP56202 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CTSWP56202 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTSWP56202 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CTSWP56202 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTSWP56202 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTSWP56202 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTSWP56202 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTSWP56202 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTSWP56202 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTSWP56202 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTSWP56202 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTSWP56202 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTSWP56202 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTSWP56202 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTSWP56202 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTSWP56202 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CTSWP56202 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTSWP56202 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTSWP56202 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTSWP56202 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTSWP56202 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTSWP56202 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTSWP56202 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTSWP56202 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTSWP56202 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTSWP56202 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTSWP56202 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CTSWP56202 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CTSWP56202 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CTSWP56202 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTSWP56202 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTSWP56202 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTSWP56202 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTSWP56202 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTSWP56202 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTSWP56202 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTSWP56202 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTSWP56202 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTSWP56202 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTSWP56202 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTSWP56202 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTSWP56202 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTSWP56202 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTSWP56202 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTSWP56202 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms