Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SUMO3P55854 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SUMO3P55854 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SUMO3P55854 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms