Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH8P55286 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH8P55286 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH8P55286 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH8P55286 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH8P55286 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH8P55286 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH8P55286 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH8P55286 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH8P55286 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH8P55286 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH8P55286 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH8P55286 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH8P55286 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH8P55286 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH8P55286 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH8P55286 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH8P55286 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH8P55286 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH8P55286 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH8P55286 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH8P55286 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH8P55286 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH8P55286 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH8P55286 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH8P55286 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH8P55286 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH8P55286 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH8P55286 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH8P55286 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH8P55286 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH8P55286 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH8P55286 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH8P55286 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH8P55286 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH8P55286 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH8P55286 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH8P55286 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDH8P55286 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDH8P55286 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH8P55286 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH8P55286 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH8P55286 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH8P55286 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH8P55286 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH8P55286 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH8P55286 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH8P55286 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH8P55286 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH8P55286 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH8P55286 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH8P55286 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH8P55286 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH8P55286 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH8P55286 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH8P55286 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH8P55286 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH8P55286 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH8P55286 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH8P55286 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH8P55286 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH8P55286 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH8P55286 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH8P55286 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH8P55286 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH8P55286 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH8P55286 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH8P55286 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH8P55286 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH8P55286 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH8P55286 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH8P55286 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH8P55286 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH8P55286 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH8P55286 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH8P55286 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH8P55286 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH8P55286 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH8P55286 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH8P55286 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDH8P55286 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH8P55286 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH8P55286 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH8P55286 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH8P55286 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH8P55286 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH8P55286 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH8P55286 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDH8P55286 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH8P55286 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH8P55286 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH8P55286 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH8P55286 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH8P55286 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH8P55286 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH8P55286 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH8P55286 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH8P55286 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH8P55286 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH8P55286 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms