Protein–RNA interactions for Protein: P52815

MRPL12, 39S ribosomal protein L12, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL12P52815 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MRPL12P52815 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MRPL12P52815 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MRPL12P52815 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms