Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCNN1GP51170 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCNN1GP51170 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCNN1GP51170 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCNN1GP51170 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms