Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HARS2P49590 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HARS2P49590 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HARS2P49590 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HARS2P49590 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HARS2P49590 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HARS2P49590 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARS2P49590 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARS2P49590 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARS2P49590 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARS2P49590 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARS2P49590 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARS2P49590 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HARS2P49590 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HARS2P49590 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HARS2P49590 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HARS2P49590 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HARS2P49590 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HARS2P49590 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HARS2P49590 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HARS2P49590 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HARS2P49590 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HARS2P49590 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HARS2P49590 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HARS2P49590 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HARS2P49590 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HARS2P49590 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HARS2P49590 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HARS2P49590 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HARS2P49590 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HARS2P49590 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HARS2P49590 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HARS2P49590 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HARS2P49590 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HARS2P49590 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HARS2P49590 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HARS2P49590 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HARS2P49590 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HARS2P49590 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HARS2P49590 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HARS2P49590 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HARS2P49590 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HARS2P49590 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HARS2P49590 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARS2P49590 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARS2P49590 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARS2P49590 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARS2P49590 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARS2P49590 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARS2P49590 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARS2P49590 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARS2P49590 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HARS2P49590 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HARS2P49590 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HARS2P49590 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HARS2P49590 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HARS2P49590 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HARS2P49590 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HARS2P49590 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HARS2P49590 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HARS2P49590 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HARS2P49590 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HARS2P49590 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HARS2P49590 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HARS2P49590 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HARS2P49590 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARS2P49590 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARS2P49590 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HARS2P49590 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HARS2P49590 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HARS2P49590 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARS2P49590 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HARS2P49590 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HARS2P49590 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HARS2P49590 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HARS2P49590 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HARS2P49590 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HARS2P49590 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARS2P49590 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARS2P49590 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARS2P49590 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARS2P49590 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARS2P49590 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARS2P49590 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HARS2P49590 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARS2P49590 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARS2P49590 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARS2P49590 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARS2P49590 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARS2P49590 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARS2P49590 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARS2P49590 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARS2P49590 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HARS2P49590 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HARS2P49590 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HARS2P49590 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HARS2P49590 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HARS2P49590 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HARS2P49590 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HARS2P49590 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms