Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA4P48169 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRA4P48169 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRA4P48169 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA4P48169 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms