Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGRP47804 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGRP47804 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGRP47804 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGRP47804 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGRP47804 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGRP47804 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGRP47804 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGRP47804 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGRP47804 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGRP47804 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGRP47804 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGRP47804 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RGRP47804 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RGRP47804 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGRP47804 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RGRP47804 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGRP47804 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RGRP47804 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGRP47804 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGRP47804 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RGRP47804 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGRP47804 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGRP47804 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGRP47804 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGRP47804 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGRP47804 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RGRP47804 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RGRP47804 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGRP47804 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGRP47804 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGRP47804 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGRP47804 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RGRP47804 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGRP47804 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RGRP47804 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGRP47804 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RGRP47804 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RGRP47804 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGRP47804 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RGRP47804 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGRP47804 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGRP47804 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGRP47804 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RGRP47804 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGRP47804 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RGRP47804 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGRP47804 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGRP47804 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGRP47804 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGRP47804 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGRP47804 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RGRP47804 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGRP47804 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGRP47804 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGRP47804 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RGRP47804 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RGRP47804 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGRP47804 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGRP47804 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGRP47804 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGRP47804 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RGRP47804 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGRP47804 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGRP47804 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGRP47804 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RGRP47804 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGRP47804 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGRP47804 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGRP47804 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGRP47804 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGRP47804 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGRP47804 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RGRP47804 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGRP47804 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGRP47804 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGRP47804 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGRP47804 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RGRP47804 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGRP47804 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGRP47804 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGRP47804 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGRP47804 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RGRP47804 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGRP47804 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGRP47804 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGRP47804 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RGRP47804 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGRP47804 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGRP47804 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGRP47804 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGRP47804 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGRP47804 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGRP47804 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGRP47804 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RGRP47804 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGRP47804 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RGRP47804 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RGRP47804 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RGRP47804 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms