Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC1A4P43007 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC1A4P43007 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC1A4P43007 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC1A4P43007 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms