Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4KAP42356 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4KAP42356 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4KAP42356 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4KAP42356 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4KAP42356 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4KAP42356 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PI4KAP42356 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4KAP42356 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4KAP42356 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4KAP42356 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4KAP42356 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4KAP42356 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PI4KAP42356 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PI4KAP42356 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PI4KAP42356 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PI4KAP42356 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms