Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH1P40692 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MLH1P40692 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH1P40692 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH1P40692 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH1P40692 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH1P40692 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH1P40692 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH1P40692 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MLH1P40692 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH1P40692 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH1P40692 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH1P40692 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MLH1P40692 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MLH1P40692 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MLH1P40692 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MLH1P40692 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MLH1P40692 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MLH1P40692 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MLH1P40692 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH1P40692 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH1P40692 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH1P40692 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH1P40692 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH1P40692 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH1P40692 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH1P40692 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH1P40692 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH1P40692 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH1P40692 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH1P40692 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH1P40692 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MLH1P40692 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH1P40692 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH1P40692 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH1P40692 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH1P40692 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH1P40692 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MLH1P40692 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH1P40692 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH1P40692 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH1P40692 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH1P40692 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH1P40692 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MLH1P40692 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH1P40692 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH1P40692 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH1P40692 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MLH1P40692 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH1P40692 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH1P40692 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH1P40692 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MLH1P40692 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
MLH1P40692 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH1P40692 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH1P40692 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH1P40692 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH1P40692 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MLH1P40692 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MLH1P40692 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MLH1P40692 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MLH1P40692 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MLH1P40692 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MLH1P40692 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MLH1P40692 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MLH1P40692 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MLH1P40692 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MLH1P40692 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MLH1P40692 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MLH1P40692 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MLH1P40692 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MLH1P40692 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MLH1P40692 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MLH1P40692 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MLH1P40692 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MLH1P40692 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MLH1P40692 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MLH1P40692 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MLH1P40692 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MLH1P40692 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MLH1P40692 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MLH1P40692 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MLH1P40692 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MLH1P40692 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MLH1P40692 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MLH1P40692 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MLH1P40692 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MLH1P40692 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MLH1P40692 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MLH1P40692 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MLH1P40692 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MLH1P40692 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MLH1P40692 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MLH1P40692 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MLH1P40692 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MLH1P40692 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MLH1P40692 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MLH1P40692 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MLH1P40692 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MLH1P40692 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms