Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP5C1P36542 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5C1P36542 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP5C1P36542 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms