Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDRP35968 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDRP35968 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDRP35968 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KDRP35968 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KDRP35968 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDRP35968 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDRP35968 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDRP35968 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
KDRP35968 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
KDRP35968 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
KDRP35968 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
KDRP35968 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
KDRP35968 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
KDRP35968 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
KDRP35968 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
KDRP35968 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
KDRP35968 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
KDRP35968 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
KDRP35968 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
KDRP35968 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
KDRP35968 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
KDRP35968 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
KDRP35968 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
KDRP35968 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
KDRP35968 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
KDRP35968 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
KDRP35968 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
KDRP35968 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
KDRP35968 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
KDRP35968 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KDRP35968 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KDRP35968 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
KDRP35968 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KDRP35968 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KDRP35968 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
KDRP35968 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KDRP35968 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KDRP35968 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KDRP35968 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KDRP35968 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KDRP35968 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KDRP35968 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
KDRP35968 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
KDRP35968 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KDRP35968 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
KDRP35968 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KDRP35968 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
KDRP35968 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KDRP35968 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
KDRP35968 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KDRP35968 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
KDRP35968 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
KDRP35968 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
KDRP35968 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDRP35968 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDRP35968 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KDRP35968 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDRP35968 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDRP35968 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDRP35968 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDRP35968 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDRP35968 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDRP35968 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KDRP35968 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
KDRP35968 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
KDRP35968 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
KDRP35968 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
KDRP35968 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
KDRP35968 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
KDRP35968 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
KDRP35968 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
KDRP35968 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KDRP35968 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
KDRP35968 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
KDRP35968 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
KDRP35968 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDRP35968 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDRP35968 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDRP35968 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDRP35968 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDRP35968 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDRP35968 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KDRP35968 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDRP35968 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDRP35968 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDRP35968 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDRP35968 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDRP35968 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KDRP35968 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDRP35968 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDRP35968 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDRP35968 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDRP35968 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDRP35968 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KDRP35968 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDRP35968 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDRP35968 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDRP35968 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KDRP35968 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms