Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.491e-6■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.354e-7■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 AP5Z1-206ENST00000491375 786 ntTSL 522.03■■□□□ 1.129e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 BPHL-207ENST00000433912 1063 ntTSL 221.81■■□□□ 1.089e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 FCHO1-210ENST00000595594 898 ntTSL 321.03■□□□□ 0.969e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 TRADD-203ENST00000563348 833 ntTSL 221.02■□□□□ 0.969e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.889e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 AP5Z1-207ENST00000496303 5660 ntTSL 219.19■□□□□ 0.669e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.659e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.39e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.289e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.279e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 MYDGF-202ENST00000596031 335 ntTSL 316.62■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 AP5Z1-204ENST00000477680 3081 ntTSL 215.86■□□□□ 0.139e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 SFSWAP-208ENST00000539506 3149 ntTSL 514.78□□□□□ -0.049e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 MYDGF-204ENST00000599761 463 ntTSL 314.1□□□□□ -0.151e-6■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.199e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 BPHL-211ENST00000488487 1137 ntTSL 513.2□□□□□ -0.39e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 PIAS4-202ENST00000593518 555 ntTSL 412.96□□□□□ -0.339e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 BPHL-212ENST00000490918 3723 ntTSL 212.93□□□□□ -0.349e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 MAD1L1-214ENST00000459731 371 ntTSL 311.31□□□□□ -0.69e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 PIAS4-204ENST00000599999 581 ntTSL 311.29□□□□□ -0.69e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 PIAS4-205ENST00000600566 624 ntTSL 211.29□□□□□ -0.69e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 BPHL-202ENST00000380375 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.699e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 BPHL-204ENST00000423798 576 ntTSL 39.36□□□□□ -0.919e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.042e-7■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.572e-7■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.392e-7■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 MAFG-203ENST00000574686 570 ntTSL 524.89■■□□□ 1.581e-7■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.971e-7■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 RBPJ-216ENST00000509158 555 ntTSL 222.63■■□□□ 1.214e-12■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.534e-12■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.424e-12■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 RBPJ-223ENST00000512671 795 ntTSL 217.42■□□□□ 0.384e-12■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.374e-12■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.074e-12■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 RBPJ-213ENST00000506956 566 ntTSL 413.77□□□□□ -0.214e-12■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 RBPJ-224ENST00000513182 537 ntTSL 49.3□□□□□ -0.924e-12■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -14e-12■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 RBPJ-222ENST00000512351 609 ntTSL 48.14□□□□□ -1.114e-12■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 RBPJ-225ENST00000514380 1519 ntTSL 26.89□□□□□ -1.314e-12■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 RBPJ-218ENST00000510778 716 ntTSL 56.69□□□□□ -1.344e-12■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 RBPJ-219ENST00000511401 577 ntTSL 55.66□□□□□ -1.54e-12■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 RBPJ-230ENST00000515023 388 ntTSL 54.97□□□□□ -1.614e-12■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 RBPJ-229ENST00000514807 340 ntTSL 34.39□□□□□ -1.714e-12■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 SND1-209ENST00000470723 568 ntTSL 413.45□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 SND1-201ENST00000354725 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 SND1-213ENST00000486037 695 ntTSL 311.68□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 SND1-211ENST00000484767 460 ntTSL 411.01□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 43.7
GTF2F1P35269 SSBP2-203ENST00000504174 632 ntTSL 526.11■■□□□ 1.776e-7■■■■■ 43.7
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GTF2F1P35269 CSRNP2-203ENST00000548206 685 ntTSL 324.12■■□□□ 1.453e-8■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 CSRNP2-207ENST00000552680 576 ntTSL 423.49■■□□□ 1.353e-8■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 CSRNP2-202ENST00000546935 681 ntTSL 522.75■■□□□ 1.233e-8■■■■■ 43.6
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GTF2F1P35269 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 CSRNP2-208ENST00000552899 449 ntTSL 412.46□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 MSI2-214ENST00000581776 493 ntTSL 26.73□□□□□ -1.332e-9■■■■■ 43.6
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GTF2F1P35269 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.792e-13■■■■■ 43.6
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GTF2F1P35269 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 SEPT9-213ENST00000586433 569 ntTSL 413.3□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 SEPT9-238ENST00000591472 555 ntTSL 412.75□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 SEPT9-234ENST00000590938 611 ntTSL 411.16□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.443e-10■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.013e-10■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-217ENST00000530650 2094 ntTSL 1 (best)25.48■■□□□ 1.676e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-219ENST00000530892 691 ntTSL 225.23■■□□□ 1.636e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-215ENST00000529414 749 ntTSL 323.16■■□□□ 1.36e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-223ENST00000533646 486 ntTSL 222.85■■□□□ 1.256e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-218ENST00000530750 365 ntTSL 522.02■■□□□ 1.126e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-216ENST00000529601 1671 ntTSL 222.01■■□□□ 1.116e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.086e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-221ENST00000531321 945 ntTSL 321.62■■□□□ 1.056e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-204ENST00000524986 729 ntTSL 321.54■■□□□ 1.046e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-214ENST00000529292 1305 ntTSL 521.52■■□□□ 1.036e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.036e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-211ENST00000528026 582 ntTSL 321.3■■□□□ 16e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-205ENST00000525385 1014 ntTSL 521.3■■□□□ 16e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-203ENST00000524690 843 ntTSL 521.27■■□□□ 16e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-208ENST00000526809 829 ntTSL 521.27■■□□□ 16e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-224ENST00000533766 1547 ntTSL 521.09■□□□□ 0.976e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-225ENST00000534371 913 ntTSL 520.98■□□□□ 0.956e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 TM7SF2-207ENST00000526085 570 ntTSL 518.26■□□□□ 0.516e-9■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 NSD3-211ENST00000534155 577 ntTSL 419.97■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.77e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 NSD3-210ENST00000529223 1032 ntTSL 516.89■□□□□ 0.297e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 NSD3-202ENST00000317025 10776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.257e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 NSD3-203ENST00000433384 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.347e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.177e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 SPATS2-212ENST00000549298 643 ntTSL 326.42■■□□□ 1.822e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 SPATS2-218ENST00000551540 720 ntTSL 525.25■■□□□ 1.632e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 SPATS2-211ENST00000549179 570 ntTSL 425.25■■□□□ 1.632e-7■■■■■ 43.6
GTF2F1P35269 SPATS2-214ENST00000549412 2781 ntTSL 223.71■■□□□ 1.392e-7■■■■■ 43.6
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