Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC8A1P32418 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC8A1P32418 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms