Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ALDH4A1P30038 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALDH4A1P30038 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH4A1P30038 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms