Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD3P28288 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCD3P28288 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCD3P28288 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ABCD3P28288 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCD3P28288 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCD3P28288 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD3P28288 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 594.6 ms