Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ITGA3P26006 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA3P26006 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA3P26006 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms