Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP100P23497 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP100P23497 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SP100P23497 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SP100P23497 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SP100P23497 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP100P23497 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP100P23497 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SP100P23497 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP100P23497 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP100P23497 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP100P23497 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP100P23497 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SP100P23497 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP100P23497 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP100P23497 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP100P23497 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP100P23497 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SP100P23497 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP100P23497 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP100P23497 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP100P23497 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP100P23497 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP100P23497 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP100P23497 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP100P23497 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SP100P23497 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP100P23497 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP100P23497 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP100P23497 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP100P23497 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP100P23497 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SP100P23497 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP100P23497 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP100P23497 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP100P23497 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SP100P23497 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP100P23497 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP100P23497 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP100P23497 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP100P23497 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SP100P23497 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SP100P23497 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP100P23497 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SP100P23497 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SP100P23497 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SP100P23497 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SP100P23497 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SP100P23497 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP100P23497 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP100P23497 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP100P23497 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP100P23497 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SP100P23497 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP100P23497 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SP100P23497 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SP100P23497 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SP100P23497 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SP100P23497 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SP100P23497 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SP100P23497 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP100P23497 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP100P23497 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP100P23497 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP100P23497 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP100P23497 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP100P23497 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP100P23497 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP100P23497 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SP100P23497 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SP100P23497 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SP100P23497 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SP100P23497 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SP100P23497 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SP100P23497 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SP100P23497 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP100P23497 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP100P23497 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP100P23497 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP100P23497 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SP100P23497 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SP100P23497 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SP100P23497 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SP100P23497 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SP100P23497 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SP100P23497 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SP100P23497 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SP100P23497 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SP100P23497 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SP100P23497 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SP100P23497 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SP100P23497 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SP100P23497 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP100P23497 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP100P23497 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP100P23497 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SP100P23497 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP100P23497 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP100P23497 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SP100P23497 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms