Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXA5P20719 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA5P20719 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXA5P20719 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 343.2 ms