Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRAP18433 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRAP18433 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PTPRAP18433 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
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