Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
XBP1P17861 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
XBP1P17861 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XBP1P17861 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XBP1P17861 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XBP1P17861 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XBP1P17861 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XBP1P17861 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XBP1P17861 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
XBP1P17861 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XBP1P17861 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XBP1P17861 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XBP1P17861 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XBP1P17861 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XBP1P17861 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XBP1P17861 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XBP1P17861 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XBP1P17861 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XBP1P17861 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XBP1P17861 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
XBP1P17861 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
XBP1P17861 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XBP1P17861 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XBP1P17861 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XBP1P17861 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XBP1P17861 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XBP1P17861 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XBP1P17861 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XBP1P17861 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XBP1P17861 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XBP1P17861 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XBP1P17861 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
XBP1P17861 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XBP1P17861 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XBP1P17861 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XBP1P17861 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
XBP1P17861 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
XBP1P17861 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XBP1P17861 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XBP1P17861 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XBP1P17861 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XBP1P17861 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XBP1P17861 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XBP1P17861 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XBP1P17861 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XBP1P17861 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XBP1P17861 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XBP1P17861 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XBP1P17861 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XBP1P17861 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XBP1P17861 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XBP1P17861 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XBP1P17861 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XBP1P17861 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
XBP1P17861 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XBP1P17861 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XBP1P17861 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XBP1P17861 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XBP1P17861 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
XBP1P17861 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XBP1P17861 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XBP1P17861 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XBP1P17861 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
XBP1P17861 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
XBP1P17861 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XBP1P17861 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XBP1P17861 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XBP1P17861 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XBP1P17861 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XBP1P17861 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XBP1P17861 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
XBP1P17861 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XBP1P17861 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XBP1P17861 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XBP1P17861 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XBP1P17861 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XBP1P17861 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XBP1P17861 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XBP1P17861 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XBP1P17861 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XBP1P17861 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XBP1P17861 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XBP1P17861 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XBP1P17861 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XBP1P17861 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XBP1P17861 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XBP1P17861 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XBP1P17861 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XBP1P17861 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XBP1P17861 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XBP1P17861 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XBP1P17861 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XBP1P17861 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XBP1P17861 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XBP1P17861 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XBP1P17861 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XBP1P17861 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
XBP1P17861 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
XBP1P17861 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XBP1P17861 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms