Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCL3L1P16619 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCL3L1P16619 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CCL3L1P16619 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms