Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACTN1P12814 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ACTN1P12814 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTN1P12814 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTN1P12814 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.3 ms